Pojkarna är 17-18 år gamla och greps och anhölls på måndagseftermiddagen.
Gripandena kunde göras efter tips till polisen.
Under tisdagen gjorde polisen husrannsakan i de misstänktas bostäder i jakt på bevis. Samtidigt förhördes trion på polisstationen i Visby.
- Jag vet ännu inte om de gjort några medgivanden, sade Magnus Frank, förundersökningsledare, på eftermiddagen.
Den senaste veckan har polisen fått in ett tiotal anmälningar om inbrott i fritidshus i Alskog och Ljugarn. Tjuvarnas främsta byter verkar ha varit alkohol.
- Vid de tekniska undersökningarna i fritidshusen säkrade vi spår som DNA, fotspår och fingeravtryck. Vi ska se om de går att matcha mot de misstänkta, berättar Magnus Frank.