En militär patrull "reagerade kraftfullt på ett bakhåll av en ännu oidentifierad beväpnad terrorgrupp" vid middagstid i Macina-området, sade armén i ett uttalande på söndagen och tillade att även tre angripare dog.
Fem militärfordon brändes i attacken.
FN-insatsen Minusma uppgav tidigare att tre soldater inom den fredsbevarande styrkan skadats under lördagen vid en explosion nära Kidal i nordost.